Plataforma de Metabolómica

La Plataforma de Metabolómica se encuentra situada en el Instituto de Investigación en Ciencias de la Alimentación (CIAL) y tiene como principal objetivo proporcionar herramientas y procedimientos avanzados para el estudio del conjunto de metabolitos existentes en un determinado sistema biológico y así obtener información de los mecanismos celulares a nivel molecular.

La Plataforma de Metabolómica forma parte de la Plataforma Proteómica-Metabolómica (CEI-UAM+CSIC). El hecho de disponer de una Plataforma de Proteómica y otra de Metabolómica en el mismo campus va a permitir desarrollar y ofrecer a la comunidad científica un abanico de tecnologías de última generación. Estas tecnologías «ómicas» requieren de un equipamiento de altas prestaciones y por su complejidad técnica exigen de una alta especialización, lo que hasta la fecha no ha estado disponible en el campus.

LABORATORIO

Nuestro laboratorio posee los equipos más modernos para el estudio de muestras biológicas, por medio de técnicas cromatográficas, tanto líquida (UHPLC) como gaseosa (GC), así como su conservación, su manipulación y su posterior análisis.

Durante los últimos años, la Plataforma de Metabolómica del CIAL ha experimentado un gran avance en cuanto a su infraestructura científico-técnica gracias a la consecución de un proyecto dentro del Fondo de Ayuda para Servicios Científico-Técnicos del CSIC, y otro dentro de la convocatoria Equipamiento Científico-Técnico 2021 (EQC-2021) de la Agencia Estatal de Investigación (AEI). Se han actualizado todos los paquetes de software informático, tanto de control de los instrumentos científicos como de análisis de datos, se han implementado tres nuevos servidores informáticos con potencia suficiente para realizar estos análisis, junto con otros dos servidores de almacenamiento de datos y, además, se ha reforzado el proceso de preparación y conservación de las muestras. Además, se ha adquirido un nuevo UHPLC acoplado a un espectrómetro de masas de alta resolución.

Estos aportes financieros han permitido la adquisición del siguiente equipamiento:

• Equipamiento informático:
• Software: Actualización y adquisición de nuevos programas informáticos licenciados.
• Hardware: Implementación de tres estaciones de trabajo para análisis masivo de datos y dos servidores de almacenamiento de datos.

• Instrumental técnico:
• Ultracongelador para -80º C.
• Sistema de secado de muestras: Concentrador Speed-Vac.
• UHPLC-Q-Orbitrap Exploris 120 (Thermo Fisher Scientific).

La Plataforma de Metabolómica CIAL forma parte de la oferta Científico-Técnica del CSIC, a través de su Catálogo de Prestaciones. El funcionamiento de la Plataforma de Metabolómica se financia con los fondos generados mediante los servicios que presta a los usuarios (grupos de investigación, entidades públicas, empresas, etc), el objetivo es mantener la autofinanciación; esto también ha permitido la adquisición de equipos menores que facilitan y mejoran el servicio ofertado.

EQUIPAMIENTO

• UHPLC-MS alta resolución

Para la realización de esta técnica cromatográfica, la Plataforma de Metabolómica dispone en el laboratorio de dos equipos:

UHPLC modelo 1290 acoplado a un espectrómetro de masas Quadrupole Time-of-flight (Q-TOF) series 6540 (Agilent Technologies).

UHPLC modelo Vanquish Horizon acoplado a un espectrómetro de masas Quadrupole Orbitrap (Q-Orbitrap) Exploris 120 (Thermo Fisher Scientific).

• GC-MS alta resolución

Para la realización de esta técnica cromatográfica, la Plataforma de Metabolómica dispone en el laboratorio del siguiente equipo:

GC modelo 7890B acoplado a un espectrómetro de masas Quadrupole Time-of-flight (Q-TOF) series 7200 (Agilent Technologies).

SERVICIOS

La Plataforma de Metabolómica ofrece asesoramiento científico y asistencia a todos los miembros de la comunidad científica, dentro y fuera del campus UAM+CSIC, así como a empresas que lo soliciten.

Dentro de estos servicios, destacan:

• Asesoramiento técnico.
• Preparación de muestras.
• Desarrollo de protocolos para su análisis.
• Determinación cualitativa y cuantitativa de metabolitos y/o familias de metabolitos mediante:
• Obtención de perfiles metabólicos.
• Realización de análisis diferencial.
• Procesamiento de datos mediante:
• Detección de picos.
• Filtrado de ruido.
• Normalización.
• Análisis multivariante.
• Identificación tentativa de metabolitos desconocidos por comparación con bases de datos, etc.