Servicios de la Plataforma de Metabolómica |
| ||
Tratamiento de la muestra - Fluidos
biológicos: plasma, suero, líquido cefalorraquídeo, orina, saliva, etc.
(desproteinización, ultrafiltración, extracción en fase sólida). | ![]() | ||
Análisis metabolómico "no-dirigido" mediante LC-Q/TOF MS Análisis metabolómico “no-dirigido” de muestras biológicas complejas empleando las plataformas analíticas UPLC-Q/TOF y nanoLC-Q/TOF. El objetivo es cubrir de la manera más completa posible el metaboloma de una determinada muestra. Se trata de uno de los princil¡pales retos en Metabolómica debido fundamentalmente a la gran variedad de estructuras químicas y el alto intervalo dinámico de concentraciones de los metabolitos en las muestras biológicas. Se puede mejorar la cobertura metabólica empleando distintos modos de extracción de metabolitos y técnicas analíticas. | ![]() | ||
Análisis “dirigido” mediante LC-Q/TOF MS Análisis dirigido mediante LC-Q/TOF MS de familias de metabolitos. | |||
Procesado de los datos Objetivo: Identificación de picos con señales m/z and tiempo de retención únicos, cuya expresión se encuentra modificada significativamente, e identificación de los metabolitos corespondientes a esas señales. Se ofrece un procesado de los datos preliminar: 4.1. Extracción de los datos crudos (cromatogramas LC-MS) para cálculos y representaciones gráficas posteriores. Formatos de los datos LC-MS: csv, tsv, xls, xlsx, mzData. 4.2. Procesado de los datos: búsqueda de picos, filtración de ruido de fondo, alineamiento de los tiempos de retención, , normalización. Se obtendrá una atriz de datos con los picos alineados correspondientes a todas las muestras. Formato de los archivos: csv, tsv, xls, xlsx. 4.3. Análisis multivariente básico. 4.4. Identificación tentativa de metabolitos mediante comparación de masas exactas experimentales y teóricas empleando basas de datos como METLIN, y perfil isotópico Mass Hunter. 4.5. Acceso al software disponible en la estación de trabajo: Mass Hunter, Mass Profiler Proffessional, XCMS, mzMine, IDEOM. | ![]() | ||
OpenAccess: - Tratamiento de la muesta, extracción de metabolitos. Almacenamiento de muestras. - Acceso a los programas informáticos (ver punto 4.5). |